宗教方面，楊秋興說，兩岸的文化交流帶動了大陸新的宗教思維，認為廈門海滄青礁保生大帝文化園區(qū)、湄洲島媽祖文化園區(qū)是這種新思維的產(chǎn)物。他很欽佩保生大帝文化園區(qū)和媽祖文化園區(qū)在不長的時間里蓋得這么有規(guī)模，但硬體上去了，還應加強軟體建設，通過兩岸宗教交流注入更多宗教內(nèi)涵。

　　楊秋興說，臺灣的宗教大部分來源自福建，現(xiàn)在臺灣宗教非常興盛，兩岸宗教交流潛力巨大；宗教交流對增進兩岸的了解和認同，對兩岸關系發(fā)展，都有重要影響。
 
　　談到訪問廈門大學臺灣研究院時，楊秋興說，他感受最深的是，他現(xiàn)在才了解到過去民進黨掌權(quán)時的高層都有來過大陸，包括現(xiàn)任的很多縣市長都有來，有的是到大陸參訪，有的是到大陸祭祖，也有的是到大陸做生意。他感到很驚訝。

　　楊秋興說，他在高雄縣長任內(nèi)沒敢到大陸，因為那時候怕被黨內(nèi)批斗。因此，當他了解到民進黨內(nèi)很多高層都來過大陸，真的感觸很深。楊秋興說，他們來過大陸之后，應該看到大陸的潛力和發(fā)展，知道臺灣的出路在哪里。楊秋興認為，兩岸應該做朋友，臺灣應該抓住大陸的發(fā)展機遇。楊秋興認為，其實臺灣很多政治人物對大陸的發(fā)展態(tài)勢是清楚的，但是受意識形態(tài)的影響，妨礙了臺灣的經(jīng)濟發(fā)展，對此感到很遺憾。