那是一段非人的日子。一間窗戶上蒙著厚棉被透不過一絲光線，面積不夠10平方米的囚室?guī)缀跏冠w伊君與世隔絕。無休止的嚴(yán)酷審訊、饑餓陷阱、人格侮辱、肉體折磨，讓他失去了往日的清醒和理性。但無論怎樣，一個信念是堅(jiān)不可摧的，那就是，“我不是特務(wù)，必須要活著出去，總有一天能夠還原歷史的真相”。

　　 把問題想透徹了，趙伊君一陣輕松。他決定拋開一切思想包袱，在應(yīng)付審訊外，潛心鉆研自己的火球物理基礎(chǔ)理論，過一種能夠自我愉悅的“囚徒”生活。

　　 思路清晰了，趙伊君立即著手鉆研如何借助群論數(shù)學(xué)方法，編制研究火球原子分子物理結(jié)構(gòu)的計(jì)算程序。囚室里沒有桌子和床，地板上只有一張褥子，每天只送兩個窩頭和一杯水，趙伊君就盤腿坐在地板上，趴著身子用寫交代材料的紙張，憑著記憶推演有關(guān)的定理和公式。

　　 讓他感到一絲慰籍的是，看管人員中有兩個原子工程系的學(xué)員，有時會趁機(jī)偷偷和他聊上兩句。學(xué)員們關(guān)心的問題很多，“現(xiàn)在停課了，為了適應(yīng)畢業(yè)后的工作應(yīng)該補(bǔ)習(xí)哪些課程？”“以后要去工作的基地是個什么樣的單位？”……對于他們的問題，趙伊君總是耐心地解答。每當(dāng)這個時候，趙伊君的心情最為舒暢。因?yàn)閺膶W(xué)員的眼神中，他看到對知識的崇拜，對老師的尊敬，看到了人心向背，也看到了中國的希望和自己的光明，無形中增添了在困境中把科學(xué)研究堅(jiān)持搞下去的信心和力量。時間久了，這些學(xué)員也大體知道他每天在畫畫寫寫些什么。內(nèi)心佩服的同時，有時也行個方便，悄悄給他多遞幾張稿紙。

　　 8個月后，“潛伏特務(wù)”的罪名不攻自破，趙伊君重獲自由。他做的第一件事，就是用整整一個月時間，把囚室里用群論方法編制研究火球原子分子物理結(jié)構(gòu)計(jì)算程序的思考成果整理出來，寫了滿滿三個筆記本。這些成果為他從事原子分子物理的研究奠定了堅(jiān)實(shí)的基礎(chǔ)。

　　鑄就大國利劍

　　 20世紀(jì)70年代，隨著中國核試驗(yàn)方式由大氣層轉(zhuǎn)入地下，趙伊君所在的光輻射測試專業(yè)前途暗淡，研究方向面臨再一次調(diào)整。趙伊君已經(jīng)數(shù)不清這是第多少次調(diào)整方向了，自從進(jìn)入軍事工程學(xué)院與國防科技事業(yè)結(jié)緣以來，他一開始搞海軍炮光學(xué)儀器教學(xué)，不久轉(zhuǎn)向海軍炮射擊指揮儀，繼而參與電子模擬計(jì)算機(jī)的研制，后來又從事核試驗(yàn)光輻射測試分析，每一次都是跨學(xué)科的大轉(zhuǎn)行。在趙伊君看來，頻繁的轉(zhuǎn)行是一般科技工作者忌諱的，但對國防科技工作者來講，則是不可避免的。因?yàn)檐娛录夹g(shù)發(fā)展迅猛，國防科技工作者必須與時俱進(jìn)，樹立緊跟前沿的意識，做好隨時把自己熟悉的東西扔掉，重新起步學(xué)習(xí)新知識的思想準(zhǔn)備，所以他能夠平靜面對并憑著厚實(shí)的基礎(chǔ)理論和融會貫通的能力，游刃有余地進(jìn)行一次又一次不自由的轉(zhuǎn)行。

　　 趙伊君和同事們討論新的研究方向時，把目光瞄準(zhǔn)了強(qiáng)激光技術(shù)。這不僅是因?yàn)榧す馀c核爆炸光輻射都是強(qiáng)光，還在于強(qiáng)激光技術(shù)在國防科技領(lǐng)域日益顯示出廣闊的應(yīng)用前景。認(rèn)準(zhǔn)了這一目標(biāo)，趙伊君在強(qiáng)激光技術(shù)領(lǐng)域一干就是40余年。

　　 在“文革”動蕩的歲月中，趙伊君和同事們多方收集激光研究的前沿動態(tài)，四處購置設(shè)備，自己動手搞加工、做試驗(yàn)，熱火朝天地干了起來。他從擅長的理論入手探索激光破壞機(jī)理，在看不到新文獻(xiàn)的情況下，在國內(nèi)首次提出固體層裂破壞理論，并編制出相應(yīng)的計(jì)算程序，在這一領(lǐng)域做出了開創(chuàng)性成果。他和同事們還參與到640-3國家任務(wù)。